Gérard Bapt, le député socialiste de Haute-Garonne et rapporteur du budget de la santé, a accusé Roselyne Bachelot d'avoir manqué de transparence dans la gestion de l'épidémie de grippe A-H1N1, selon le quotidien Sud-Ouest dans son édition de dimanche. Gérard Bapt, qui dispose de pouvoirs d'investigation en tant que rapporteur du budget de la santé, explique notamment avoir découvert le 7 janvier que l'Établissement de préparation et de réponse aux urgences sanitaires (Eprus) "avait déjà en stock, depuis le début du mois de décembre, 800.000 seringues de vaccination unidoses, de fabrication Novartis". Or la ministre de la Santé n'a admis que le 4 janvier l'existence de ces stocks "pour justifier l'autorisation enfin accordée aux généralistes de procéder aux vaccinations contre la grippe AH1N1". Le député aurait également découvert que la France avait vendu dès le mois de novembre 300 000 doses de vaccin au Qatar.