La participation en Franche-Comté atteignait 49,65% à 17 heures pour le second tour des régionales, selon le ministère de l'Intérieur. La participation est en hausse par rapport à dimanche dernier (43,06%), en baisse par rapport au second tour des régionales de 2004 (54,32%). En Franche-Comté, il y a une triangulaire avec comme troisième force le Front national.